Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK2O60296 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms