Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM6AO15550 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms