Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms