Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKBIEO00221 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms