Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCER2I3L3R5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCER2I3L3R5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms