Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C1D1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C1D1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C1D1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C1D1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C1D1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms