Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms