Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDKN3Q16667 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms