Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA4Q16363 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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