Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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E2F4Q16254 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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E2F4Q16254 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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E2F4Q16254 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
E2F4Q16254 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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