Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZIC1Q15915 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ZIC1Q15915 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZIC1Q15915 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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