Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms