Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAM2Q15035 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms