Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
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GPNMBQ14956 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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GPNMBQ14956 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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GPNMBQ14956 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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GPNMBQ14956 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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