Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SCARF1Q14162 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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