Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE4AQ14139 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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UBE4AQ14139 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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UBE4AQ14139 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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UBE4AQ14139 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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