Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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SCARB2Q14108 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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SCARB2Q14108 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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SCARB2Q14108 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SCARB2Q14108 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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