Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RUNX2Q13950 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RUNX2Q13950 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RUNX2Q13950 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RUNX2Q13950 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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