| RUNX2 | Q13950 | AL592309.2-201 | ENST00000444647 | 607 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL39P40-201 | ENST00000445481 | 146 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025918.1-201 | ENST00000452467 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P10-201 | ENST00000455912 | 772 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-152P-201 | ENST00000458982 | 64 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P39-201 | ENST00000463605 | 483 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPGP7-201 | ENST00000469016 | 106 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087190.1-201 | ENST00000484462 | 480 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093591.1-201 | ENST00000491435 | 481 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P16-201 | ENST00000495531 | 483 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005741.1-201 | ENST00000511094 | 432 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097467.1-201 | ENST00000513660 | 370 nt | TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACA59.1-201 | ENST00000515966 | 143 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU5F-2P-201 | ENST00000516066 | 82 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | MIR5696-201 | ENST00000578474 | 85 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC060766.3-201 | ENST00000591442 | 263 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073410.2-201 | ENST00000603240 | 332 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006026.1-201 | ENST00000444025 | 1803 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-212P-201 | ENST00000362642 | 104 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.13-201 | ENST00000364804 | 214 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | TRDJ3-201 | ENST00000390476 | 59 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02331-201 | ENST00000418927 | 602 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC112220.1-201 | ENST00000434628 | 355 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004869.2-201 | ENST00000436501 | 229 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244670.1-201 | ENST00000436879 | 112 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL118523.1-201 | ENST00000444436 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL357873.1-201 | ENST00000449215 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022445.1-201 | ENST00000457499 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090525.1-201 | ENST00000479116 | 478 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010420.1-201 | ENST00000515077 | 509 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5571-201 | ENST00000577998 | 113 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022035.1-201 | ENST00000579923 | 302 nt | TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MSMB-202 | ENST00000582163 | 488 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3605-201 | ENST00000583214 | 100 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100778.1-201 | ENST00000583579 | 332 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL078605.1-201 | ENST00000603529 | 500 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL050343.2-201 | ENST00000607338 | 280 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359314.1-201 | ENST00000616913 | 261 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL449363.1-201 | ENST00000617815 | 186 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NCBP1-205 | ENST00000629069 | 249 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLD-214 | ENST00000639772 | 421 nt | TSL 5 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CENPE-201 | ENST00000265148 | 8612 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEUP1-202 | ENST00000525646 | 1920 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HERC4-201 | ENST00000277817 | 4371 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HIF1A-201 | ENST00000323441 | 3555 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000560.1-201 | ENST00000624150 | 1937 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC135776.4-201 | ENST00000624300 | 1904 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA5B-201 | ENST00000363786 | 132 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.259-201 | ENST00000364619 | 101 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.533-201 | ENST00000384596 | 114 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-331P-201 | ENST00000384724 | 107 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR218-1-201 | ENST00000384999 | 110 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ34-201 | ENST00000390503 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP4-201 | ENST00000401524 | 249 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC243428.1-201 | ENST00000421099 | 264 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC078809.1-201 | ENST00000427601 | 140 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00459-201 | ENST00000431656 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02336-201 | ENST00000434117 | 330 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105272.1-201 | ENST00000438604 | 198 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02041-201 | ENST00000440726 | 246 nt | TSL 5 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP24-201 | ENST00000456370 | 334 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103975.1-201 | ENST00000482506 | 483 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL30P1-201 | ENST00000488676 | 339 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC063944.1-201 | ENST00000496943 | 295 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-53P-201 | ENST00000516257 | 147 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCARNA16.2-201 | ENST00000516520 | 172 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CBX3P8-201 | ENST00000532412 | 525 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02425-201 | ENST00000536217 | 376 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GTF3AP2-201 | ENST00000557014 | 266 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP29-201 | ENST00000588193 | 334 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084781.2-201 | ENST00000615568 | 161 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P24-202 | ENST00000615653 | 685 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01684-201 | ENST00000415182 | 2176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.48-201 | ENST00000362710 | 103 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.504-201 | ENST00000384481 | 104 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.510-201 | ENST00000384511 | 114 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL078595.1-201 | ENST00000404458 | 226 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590004.2-201 | ENST00000404787 | 371 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP21-201 | ENST00000410917 | 96 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USMG5P1-201 | ENST00000425964 | 177 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589935.1-209 | ENST00000432050 | 418 nt | TSL 5 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2DNL-203 | ENST00000474922 | 222 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AIG1P1-201 | ENST00000503376 | 148 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016632.1-201 | ENST00000503994 | 196 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097473.1-201 | ENST00000508142 | 408 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA9.3-201 | ENST00000516383 | 129 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC124657.1-201 | ENST00000527819 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008083.3-202 | ENST00000552063 | 277 nt | TSL 3 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018554.1-202 | ENST00000565133 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005014.2-201 | ENST00000607795 | 599 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLEU2_6.1-201 | ENST00000610536 | 112 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ST7-AS2-206 | ENST00000456577 | 1351 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CHD9-218 | ENST00000566029 | 13110 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P9-201 | ENST00000503854 | 1755 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |