Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
PMS2P11Q13670 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PMS2P11Q13670 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.5 ms