Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms