Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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PRDM2Q13029 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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PRDM2Q13029 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
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PRDM2Q13029 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRDM2Q13029 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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