Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NFX1Q12986 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms