Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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