Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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