Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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