Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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