Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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PTPRQQ9UMZ3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRQQ9UMZ3 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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