Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCL28Q9NRJ3 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms