Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms