Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms