Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USF2Q15853 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USF2Q15853 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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