Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms