Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FHL3Q13643 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms