Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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