Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PSMD2Q13200 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms