Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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