Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NFIAQ12857 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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