Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
BPTFQ12830 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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