Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms