Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LINC00587B1AMM8 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
LINC00587B1AMM8 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.2 ms