Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PSDA5PKW4 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms