Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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