| CTXN3 | Q4LDR2 | AC105245.1-201 | ENST00000581934 | 244 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4435-1-201 | ENST00000582552 | 80 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091135.1-201 | ENST00000585943 | 307 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC243960.4-201 | ENST00000600532 | 288 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3976-201 | ENST00000606807 | 139 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC019193.3-201 | ENST00000609144 | 554 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL133215.3-201 | ENST00000609801 | 448 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TPTEP1-208 | ENST00000636884 | 213 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MAPK10-266 | ENST00000641066 | 6555 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND5P19-201 | ENST00000424872 | 1794 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SEMG1-201 | ENST00000372781 | 1662 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND4P12-201 | ENST00000498999 | 1377 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | GYPA-201 | ENST00000324022 | 751 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MT-ND1-201 | ENST00000361390 | 956 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-227P-201 | ENST00000362865 | 103 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-306P-201 | ENST00000384617 | 107 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL356432.1-201 | ENST00000405809 | 419 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EIF4EP4-201 | ENST00000424916 | 578 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC00459-201 | ENST00000431656 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL592309.2-201 | ENST00000444647 | 607 nt | TSL 5 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC104389.3-201 | ENST00000445629 | 235 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL513328.1-201 | ENST00000446460 | 224 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND5P5-201 | ENST00000503764 | 376 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC114801.2-201 | ENST00000503825 | 781 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC109927.1-202 | ENST00000511951 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-54P-201 | ENST00000517181 | 120 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TMCO5B-203 | ENST00000529623 | 509 nt | TSL 4 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092746.1-201 | ENST00000542819 | 562 nt | TSL 4 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02386-203 | ENST00000552182 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL139193.1-201 | ENST00000554967 | 539 nt | TSL 4 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC100778.1-201 | ENST00000583579 | 332 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP88-201 | ENST00000605759 | 454 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL161423.1-201 | ENST00000613700 | 262 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR6128-201 | ENST00000615528 | 109 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL159153.1-201 | ENST00000619688 | 317 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01938-201 | ENST00000521341 | 1864 nt | TSL 2 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF117-204 | ENST00000620222 | 5317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CFHR4-202 | ENST00000367416 | 2178 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RTKN2-202 | ENST00000373789 | 6641 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CHD9-202 | ENST00000398510 | 11337 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AGR3-201 | ENST00000310398 | 749 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1141P-201 | ENST00000364520 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD32A-201 | ENST00000364805 | 84 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-109P-201 | ENST00000383960 | 147 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-220P-201 | ENST00000390919 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR548K-201 | ENST00000408406 | 116 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC074085.1-201 | ENST00000413598 | 418 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02331-201 | ENST00000418927 | 602 nt | TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008267.5-201 | ENST00000424928 | 265 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z82205.1-201 | ENST00000428456 | 297 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS3AP52-201 | ENST00000435639 | 297 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SIRPG-AS1-201 | ENST00000437384 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS29P27-201 | ENST00000463711 | 170 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SL429P-201 | ENST00000479090 | 223 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SL489P-201 | ENST00000486185 | 223 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SL327P-201 | ENST00000488659 | 223 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC113383.1-204 | ENST00000507060 | 552 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SKP24-201 | ENST00000515888 | 284 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-507P-201 | ENST00000516045 | 100 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP282-201 | ENST00000516355 | 108 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC124290.1-202 | ENST00000523342 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HSPE1P4-201 | ENST00000550617 | 308 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009120.5-201 | ENST00000561669 | 475 nt | TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC023824.2-201 | ENST00000566185 | 400 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC124303.1-201 | ENST00000605703 | 360 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SL853P-201 | ENST00000617250 | 223 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HELLS-201 | ENST00000239026 | 2740 nt | TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TLK1-206 | ENST00000434911 | 2156 nt | TSL 2 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MBNL3-205 | ENST00000370857 | 8760 nt | TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SENP7-205 | ENST00000394091 | 4434 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MCF2-204 | ENST00000414978 | 3813 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNF219-AS1-214 | ENST00000607862 | 6001 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009541.1-201 | ENST00000438279 | 2662 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL161431.1-201 | ENST00000618966 | 4205 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-655P-201 | ENST00000362858 | 107 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.142-201 | ENST00000363491 | 102 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DEFB134-201 | ENST00000382205 | 314 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02336-201 | ENST00000434117 | 330 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092755.1-201 | ENST00000441746 | 97 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL442638.1-201 | ENST00000443359 | 237 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | snoU13.14-201 | ENST00000459372 | 104 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02046-202 | ENST00000481334 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091874.1-201 | ENST00000511402 | 339 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PTP4A1P4-201 | ENST00000512479 | 322 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-875P-201 | ENST00000516488 | 106 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC083973.1-205 | ENST00000518994 | 601 nt | TSL 2 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC011092.2-201 | ENST00000533659 | 586 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC027176.1-201 | ENST00000560204 | 514 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | POLR3GP2-201 | ENST00000588366 | 668 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL30P11-203 | ENST00000598995 | 310 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL356157.2-201 | ENST00000605122 | 111 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC018889.1-201 | ENST00000605372 | 397 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR8076-201 | ENST00000611401 | 83 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | UBE2E2-206 | ENST00000613545 | 282 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC104260.1-201 | ENST00000616660 | 539 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC023490.3-201 | ENST00000621762 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP000550.4-201 | ENST00000639507 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |