Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TPRNQ4KMQ1 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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