Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FXNQ16595 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FXNQ16595 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FXNQ16595 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FXNQ16595 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FXNQ16595 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
FXNQ16595 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FXNQ16595 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FXNQ16595 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FXNQ16595 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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