Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NKX1-1Q15270 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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