Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDX39BQ13838 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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