Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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