Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PDE3BQ13370 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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