Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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